西山　康太郎Kotaro　NISHIYAMA

基礎科学特別研究員
博士（理学）

西山康太郎の写真
 
  • 理化学研究所 環境資源科学研究センター 分子生命制御研究チーム 基礎科学特別研究員
  • 〒351-0198 埼玉県和光市広沢2番1号 生物科学研究棟 N401
  • E-mail: kotaro.nishiyama [at] riken.jp ※[at]は@に置き換えてください。

    • 経歴

    • 2012年3月 筑波大学理工学群化学類 卒業
    • 2014年3月 東京大学大学院理学系研究科化学専攻 修士課程修了
    • 2017年3月 東京大学大学院理学系研究科化学専攻 博士課程修了

    • 2014年10月 フォトンサイエンス・リーディング大学院（博士課程教育リーディングプログラム）奨学生
    • 2017年4月 東京理科大学研究推進機構生命医科学研究所 ポストドクトラル研究員
    • 2018年4月 東京大学大学院理学系研究科化学専攻 客員共同研究員
    • 2018年10月 理化学研究所 環境資源科学研究センター 分子生命制御研究チーム 特別研究員
    • 2021年4月 理化学研究所 環境資源科学研究センター 分子生命制御研究チーム 基礎科学特別研究員

    研究キーワード

    • ケミカルバイオロジー、生体機能関連化学、超分子化学、核酸化学

    受賞

    • 2016年9月 The 43rd Internal Symposium on Nucleic Acid Chemistry Outstanding Poster Award
    • 2015年9月 第9回バイオ関連化学シンポジウム ポスター賞 (Organic & Biomolecular Chemistry Award)
    • 2015年5月 日本化学会第95春季年会 学生講演賞
    • 2014年10月 錯体化学会第64回討論会 学生講演賞

    研究業績

    Original papers

    1. Kotaro Nishiyama, Keita Mori, Yusuke Takezawa, Mitsuhiko Shionoya "Metal-responsive reversible binding of triplex-forming oligonucleotides with 5-hydroxyuracil nucleobases" Chem. Commun, 57, 2487-2490 (2021).
      Selected as an outside back cover
    2. Yusuke Takezawa, Akira Suzuki, Manabu Nakaya, Kotaro Nishiyama, Mitsuhiko Shionoya "Metal-Dependent DNA Base Pairing of 5-Carboxyuracil with Itself and All Four Canonical Nucleobases" J. Am. Chem. Soc., 142, 21640-21644 (2020).
    3. Kotaro Nishiyama, Yusuke Takezawa, Mitsuhiko Shionoya "pH-Dependence of the thermal stability of metallo-DNA duplexes containing ligand-type 5-hydroxyuracil nucleobases" Inorg. Chem. Acta, 452, 176-180 (2016).
    4. Yuki Kanai, Ryu Nishimura, Kotaro Nishiyama, Tomokazu Shibata, Sachiko Yanagisawa, Takashi Ogura, Takashi Matsuo, Shun Hirota, Saburo Neya, Akihiro Suzuki, Yasuhiko Yamamoto "Effects of Heme Electronic Structure and Distal Polar Interaction on Functional and Vibrational Properties of Myoglobin" Inorg. Chem., 55, 1613-1622 (2016).
    5. Yusuke Takezawa, Kotaro Nishiyama, Tsukasa Mashima, Masato Katahira, Mitsuhiko Shionoya "Bifacial Base-Pairing Behaviors of 5-Hydroxyuracil DNA Bases through Hydrogen Bonding and Metal Coordination" Chem. Eur. J., 21, 14713-14716 (2015).

    Review papers

    1. 西山康太郎 "5-ヒドロキシウラシル塩基の金属錯体形成を駆動力としたDNA二重鎖形成挙動の制御" 日本化学会生体機能関連化学ニュースレター, 30 (4), 8 (2016).
    2. 西山康太郎 "DNA二重鎖中における5-ヒドロキシウラシル塩基と希土類イオンとの錯体形成挙動" Bull. Jpn. Soc. Coord. Chem., 65, 55–57 (2015).